تعتبر وحدة الخداج في المستشفى واحدة من احدث وحدات الخداج على مستوى الأردن حيث حرصت الأدارة منذ تأسيسها على مواكبة أحدث ما توصل اليه طب الأطفال من تقنيات ومعدات في علم الخداج ، وسجلت الوحدة قصص نجاح عديدة لعلاج كثير من أمراض حديثي الولادة والأطفال الخدج .

ويقوم بأستقبال الاطفال الذين هم بحاجة الى عناية فائقة وحثيثة ، الاطفال الخدج ، عدم اكتمال الرئة ، الاطفال الذين يعانون من امراض بحاجة الى مراقبة مستمرة مثل التشوهات الخلقية ،  التشنجات ، والاصفرار ، و اضطراب نبضات القلب والتشوهات الخلقية بالقلب  . بأستخدام احدث الحاضنات واجهزة مراقبة القلب ، اجهزة انعاش المواليد ،واجهزة العلاج الضوئي

بالاضافة الى حاضنات غرف العزل مجهزة ومهئية لأستقبال حالات العزل من داخل المستشفى وخارجه .